Cơ cấu tổ chức quản lý của công ty cổ phần đã được quy định cụ thể trong luật doanh nghiệp 2014. Theo đó thì tùy vào mô hình tổ chức quản lý và hoạt động mà công ty chọn sẽ có các chức danh quản lý tương ứng với từng mô hình.
Công ty cổ phần có Đại hội đồng cổ đông, Hội đồng quản trị và Giám đốc hoặc Tổng giám đốc; đối với công ty cổ phần có trên mười một cổ đông là cá nhân hoặc có cổ đông là tổ chức sở hữu trên 50% tổng số cổ phần của công ty phải có Ban kiểm soát.
Ngày 11 tháng 10 năm 2010 Chính phủ ban hành nghị định 104/2010/NĐ-CP tổ chức quản lý của công ty nhà nước phục vụ quốc phòng, an ninh với nội dung cụ thể:
